editor`s choice by Xiong20100304

1, Cotranscriptional coupling of splicing factor recruitment and precursor messenger RNA splicing in mammalian cells, Karla M Neugebauer, NSMB, 2006.

this paper give some interesting method to decipher the cotransciptional mechanism, by RNA

binding protein CHIP or histone marker immunoprecipition to get the chromatin-RNA complex. further thinking

越来越多的新发现的非编码RNA ，对于这些非编码为什么而存在，为什么存在那个地方的解释，必将对基因表达调控领域带来革命性的突破，很高兴我们可以见证并参与这一过程。

来自promoter， enhancer的一些非编码RNA，究竟是是维持该区域转录活性的副产品，还是其本身也具有重要的调控作用。这些转录本在细胞特异性的决定，细胞过程的转变（分化，肿瘤发生）中必然起着决定性的作用。

···················································假说及相关验证试验，正在开展中·······························

对于房东（一个单身的美国老头）来说，天晴时， running is great fun!

对于roommate（一个意大利的female Ph.D)来说，周末 tour around，meet friends is great fun!

对于 supervisor 来说，在library / coffe shop, think about scientific promblem is great fun!

对于college （一个印度裔的postdoc），hike is great fun !

太极，打电话跟朋友胡扯，与同事讨论，听安静的音乐················

朋友告诉我要做最好的自己，我觉得很对，要做最好的自己。今天收到了一位读者的来信，感觉很好，最近自己状态不佳，处在低谷。有人主动找自己聊科研，是一件很惬意的事情。今天，看了以前在家照的照片，突然觉得自己为了一些感情的破事，而郁闷，很傻。人不能忘本，自己是农民的儿子，就应该踏踏实实的做事情，远离乡村的土地，有时会让自己有些飘。以前每次回家，除了回家可以看到父母，很重要的一方面，就是自己的内心的到沉淀。昨天过小年，给妈妈打电话了，昨天很累，周六到十点多才回，中午和晚上都是吃泡面解决的，不敢跟妈妈说，怕她担心。家里在炸圆子，她问我想吃什么，她可以寄过来。我说我什么都想吃。突然感觉自己眼睛有些湿。朋友说的对，做最好的自己。

曾经有人对我说，你除了科研什么都不会, 所以你只有做科研。 我信以为真，喜欢那种简单的快乐。但是最近在为什么要做科研上想了一些，写下来：

1， 科学研究不会保证你过上锦衣玉食的生活， 但是它绝对可以成为你谋生的手段。我是一个喜欢不断有一些新鲜事物刺激的人，科学研究正好可以满足我的这一需要。我喜欢别人听我来讲，并且他们会很快乐，科学研究在某种意义上是为了显摆。

2， 这个世界充满了不公平，从读小学起，就会有些，成天看见他们玩，但考试仍然拿第一的人。科学研究至少给我提供了一个相对公平的舞台，因为科研是一个不断积累的过程，玩不了巧，我比较笨，这个比较适合我。

3， 人在世上总会试图证明自己，得到他人的认可，听起来很傻，但是应该没有人能够逃脱这个魔咒。科学研究会让你得到别人的认可，证明自身的价值所在，这种认可所带来的自我满足和快感，是吸引许多人的地方，当然包括我。

花甲花开花落心未落，

时态时浮时沉志不沉。

朋友跟我说，竞争谁先发文章。新年加油！为自己，自己爱的人和爱自己的人！

31, NoncodingTranscription by RNA Polymerase Pol IVb/Pol V Mediates Transcriptional Silencing of Overlapping and Adjacent Genes. Craig S. Pikaard, cell, 2009.

在拟南芥中，聚合酶Pol IVb/Pol V 产生的转录本，可以募集siRNA复合体，及与染色质修饰相关的酶，造成该转录本邻近转座子基因的沉默。这一发现给非编码领域带来很多思考，RNA自身不会有活性(核酶除外), 很有可能大多数的非编码RNA只是起着骨架作用，而且柔性极强的RNA也具有作为骨架的先天优势。其实早在1986年科学家就通过电镜技术发现用RNase处理后，核骨架基本瓦解。从这层面上讲，非编码RNA的功能就应该有其募集的因子决定，所以现在认识的非编码RNA的角色，可能只是冰山一角。

21, Prolyl 4-hydroxylation regulates Argonaute 2 stability. Yang Shi, nature, 2008.

The let-7 target gene mouse lin-41 is a stem cell specific E3 ubiquitin ligase for the miRNA pathway protein Ago2. F. Gregory Wulczyn, NCB, 2009.

MiRNA effector 的翻译后修饰如何调控miRNA 行使功能的研究参考上述工作。

22, Posttranscriptional Crossregulation between Drosha and DGCR8. V. Narry Kim, cell, 2009.

11，Multivesicular bodies associate with components of

miRNA effector complexes and modulate miRNA activity，Olivier Voinnet，NCB, 2009.

Silencing by small RNAs is linked to endosomal trafficking. Richard W. Carthew NCB, 2009.

上述两篇文章对于研究miRNA的定位有非常好的借鉴意义。

12， Biological basis for restriction of microRNA targets to

the 3` untranslated region in mammalian mRNAs. Mark A Kay, NSMB, 2009.